Charita Třeboň je církevní neziskovou organizací, která byla zřízena českobudějovickým biskupem ThDr. Antonínem Liškou jako účelové zařízení římskokatolické církve s vlastní právní subjektivitou od 1. 9. 2001. Svou profesionalizací navázala na dlouholetou činnost dobrovolníků ve farnosti. Charita Třeboň je organizační složkou Diecézní charity České Budějovice a členem Charity Česká republika. Předmětem činnosti Charity je pomoc lidem v nouzi na křesťanských principech.
 
Charita Třeboň poskytuje sociální služby osobám v krizi, seniorům a osobám se zdravotním postižením. Provozuje Pečovatelskou službu Astra, Občanskou poradnu a Sociálně terapeutickou dílnu Motýl. Charita Třeboň provozuje dále Půjčovnu kompenzačních pomůcek a také Středisko pomoci pro lidi v obtížných životních situacích. Úzce spolupracuje např. při povodních a dalších činnostech bezprostřední pomoci druhým. Věnuje se řadě aktivit, mezi které patří sbírková činnost, příprava a realizace kulturních, společenských a dalších aktivit.

„Charita Třeboň je součástí Diecézní charity České Budějovice a jejím posláním je služba milosrdné lásky všem lidem v nouzi bez rozdílu.“